Virofizik (virophysics)

Virofizik, viryonlar ve hücreler arasındaki etkileşimleri yönlendiren mekaniği ve dinamikleri incelemek için fiziğin teorik kavramlarının ve deneysel tekniklerinin uygulandığı bir biyofizik dalıdır.

Virofizikteki araştırmalar tipik olarak virüslerin fiziksel yapısını ve yapısal özelliklerini, toplanma ve dağılma dinamiklerini, enfeksiyon süresince popülasyon kinetiklerini ve çeşitli gerilimlerin ortaya çıkışını ve evrimini çözmeye odaklanır. Bu çabaların ortak amacı, viral enfeksiyonlarda yer alan tüm süreçlerin ayrıntılarını güvenilir tahmin gücüyle niceliksel olarak tanımlayan bir dizi model (ifadeler veya yasalar) oluşturmaktır.

Bu kadar niceliksel bir virüs anlayışına sahip olmak, yalnızca viral enfeksiyonların seyrini önlemek, yönlendirmek veya kontrol etmek için stratejilerin geliştirilmesini rasyonelleştirmekle kalmaz, aynı zamanda virüs süreçlerinden yararlanmak ve virüsü, nanobilimler, materyaller ve biyoteknoloji gibi alanlarda çalışmalara dahil etmek için de kullanılabilir.

Geleneksel olarak in vivo ve in vitro deneyler viral enfeksiyonları araştırmaların tek yolu olmuştur. Yalnızca deneysel gözlemlere dayalı bilgi elde etmeye yönelik bu yaklaşım, sağduyulu varsayımlara dayanır (örneğin, daha yüksek virüs sayısı, daha uygun virüs anlamına gelir).

Bu varsayımlar, bu karmaşık sistemlerin bireysel bileşenlerini diğerlerini etkilemeden kontrol etmedeki zorluklar nedeniyle sıklıkla test edilmez. Bununla birlikte, bu tür sistemleri tanımlamak için matematiksel modellerin ve bilgisayar simülasyonlarının kullanılması, deneysel bir sistemi bireysel bileşenlere ayırmayı ve parçaların gözlemlediğimiz enfeksiyonu oluşturmak için nasıl bir araya geldiğini belirlemeyi mümkün kılar.

Virofizik diğer alanlarla büyük örtüşmelere sahiptir. Örneğin, bulaşıcı hastalık dinamiklerinin modellenmesi matematikte, özellikle de uygulamalı matematik veya matematiksel biyolojide popüler bir araştırma konusudur.

Matematikteki modelleme çabalarının çoğu, bulaşıcı hastalıkların yayılma dinamiklerini epidemiyolojik ölçekte (kişiden kişiye) açıklamaya odaklanmış olsa da, hücresel ölçekte (hücreden hücreye) yapılan önemli çalışmalar da vardır.

Virofizik, bir hücre kültürü (in vitro), bir organ veya bir bütün içinde yayılan viral enfeksiyonun zamansal ve mekansal dinamiklerini çözmek için fiziksel modellerden yararlanarak neredeyse yalnızca tek hücreli veya çok hücreli ölçeğe odaklanır..

 

https://en.wikipedia.org/wiki/Virophysics

31 Ağustos 2024

 

GERİ (biyoloji)