Southern blot, DNA örneklerinde belirli bir DNA dizisinin tespiti ve nicelendirilmesi için kullanılan bir yöntemdir. Bu yöntem moleküler biyolojide kullanılır. Kısaca, biyolojik bir numuneden (kan veya doku gibi) saflaştırılmış DNA, kısıtlama enzimleriyle sindirilir ve elde edilen DNA fragmanları, küçük fragmanların daha büyük fragmanlardan daha hızlı hareket etmesini sağlayan elek benzeri bir jel veya matris boyunca hareket ettirmek için, bir elektrik akımı kullanılarak ayrılır.
DNA
fragmanları jelden veya matristen katı bir membrana aktarılır ve bu daha sonra
radyoaktif, floresan veya kimyasal etiketle etiketlenmiş bir DNA probuna maruz
bırakılır. Etiket, DNA prob sekansı ile tamamlayıcı sekanslar içeren herhangi
bir DNA fragmanının Southern blot içerisinde görselleştirilmesine olanak tanır.
Southern
blot, elektroforezle ayrılmış DNA fragmanlarının, blotlama adı verilen bir
işlemle bir filtre membranına transferini ve ardından prob hibridizasyonuyla
fragman tespitini birleştirir.
Yöntem,
adını, onu ilk kez 1975'te yayınlayan İngiliz biyolog Edwin Southern'den
almıştır. Benzer ilkeleri kullanan, ancak RNA veya protein kullanan diğer blot yöntemleri
(örn., Western blot, Northern blot, Eastern blot, Southwestern blot) daha sonra
kullanılmaya başlanmıştır; Southern'nın adından bir tür kelime oyunu olarak
pusula yönlerine göre adlandırılmıştır. Etiket aynı adı taşıdığından, özel
isimlerde olduğu gibi Southern büyük harfle yazılır. Diğer blotlama
yöntemlerinin adları da benzetme yoluyla bu kurala uygun olabilir.
https://en.wikipedia.org/wiki/Southern_blot
15
Temmez 2024
GERİ (biyoloji)
