Moleküler modelleme, moleküllerin davranışını modellemek veya taklit etmek için kullanılan teorik ve hesaplamalı tüm yöntemleri kapsar.
Yöntemler,
küçük kimyasal sistemlerden büyük biyolojik moleküllere ve malzeme
düzeneklerine kadar değişen moleküler sistemleri incelemek için, hesaplamalı
kimya, ilaç tasarımı, hesaplamalı biyoloji ve malzeme
bilimi alanlarında kullanılır.
Moleküler
modellemede en basit hesaplamalar elle yapılabilir, ancak makul boyuttaki
herhangi bir sistemin moleküler modellemesini yapmak için kaçınılmaz olarak
bilgisayarlar gerekir.
Moleküler
modelleme yöntemlerinin ortak özelliği, moleküler sistemlerin atomistik düzeyde
tanımlanmasıdır. Bu, atomları en küçük bireysel birim olarak ele almayı (bir
moleküler mekanik yaklaşımı) veya kuarkları, anti-kuarkları ve gluonları ile
protonları ve nötronları, fotonları ile elektronları (bir kuantum
kimyası yaklaşımı) açıkça modellemeyi içerebilir.
Moleküler
modelleme yöntemleri artık inorganik, biyolojik ve polimerik sistemlerin
yapısını, dinamiklerini, yüzey özelliklerini ve termodinamiklerini araştırmak
için rutin olarak kullanılmaktadır. Kuvvet alanının çok sayıda moleküler modeli
günümüzde veritabanlarında kolayca bulunabilmektedir. Moleküler modelleme
kullanılarak araştırılan biyolojik aktivite türleri arasında protein
katlanması, enzim katalizi, protein stabilitesi, biyomoleküler fonksiyonla
ilişkili konformasyonel değişiklikler ve proteinlerin, DNA'nın ve membran
komplekslerinin moleküler tanınması yer alır.
https://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_modelling
17 Ağustos 2023
