İn Silico (in silico)

Biyoloji ve diğer deneysel bilimlerde ‘in silico’ deneyi, bilgisayarla veya bilgisayar simülasyon yazılımı aracılığıyla gerçekleştirilen bir deneydir. Bu ifade, bilgisayar çiplerindeki silikona atıfta bulunan, Latince 'silikon içinde' anlamına gelir (in silicio). 1987 yılında biyolojide (özellikle sistem biyolojisinde) yaygın olarak kullanılan in vivo, in vitro ve in situ, Latince ifadelere bir gönderme olarak türetilmiştir; ‘in vivo’ canlı organizmalarda, ‘in vitro’ canlı organizmaların dışında ve ‘in situ’ doğada bulundukları yerlerde yapılan deneylere gönderme yapar.

Bu ifadenin bilinen en eski kullanımı, 1987 yılında Los Alamos Ulusal Laboratuvarı Doğrusal Olmayan Araştırmalar Merkezi'nde bu konuyla ilgili bir çalıştayın duyurusunda, yapay yaşamı tanımlamak için Christopher Langton tarafından kullanılmıştı. ‘İn silico’ ifadesi ilk olarak biyolojik yaşamı karakterize etmek için kullanıldı. 1989 yılında ‘National Autonomous University of Mexico’dan bir matematikçi olan Pedro Miramontes tarafından tamamen bilgisayarda gerçekleştirilen deneyler, 'DNA ve RNA Fizikokimyasal Kısıtlamalar, Hücresel Otomata ve Moleküler Evrim' dir. Çalışma daha sonra Miramontes tarafından tez çalışması olarak sunuldu.

In silico, Avrupa Topluluğu Komisyonu tarafından bakteriyel genom programlarının oluşturulmasını desteklemek için yazılan teknik incelemelerde kullanılmıştır. İn silico'nun yer aldığı ilk referanslı makale 1991 yılında bir Fransız ekip tarafından yazılmıştır. İn silico'nun yer aldığı ilk referanslı kitap bölümü 1990 yılında Hans B. Sieburg tarafından yazılmış ve Santa Fe Enstitüsü'ndeki Karmaşık Sistemler Üzerine Yaz Okulu sırasında sunulmuştur.

İn silico ifadesi başlangıçta yalnızca doğal veya laboratuvar süreçlerini (tüm doğa bilimlerinde) modelleyen bilgisayar simülasyonları için geçerliydi ve genel olarak bilgisayar tarafından yapılan hesaplamalara atıfta bulunmuyordu.


(a) Siliko ilaç tasarımında, ‘in silico’ terimi, çalışma ve analiz için bilgisayar tabanlı deneylerin kullanılması anlamına gelir (microbenotes), (b) biyoloji ve diğer deneysel bilimlerde ‘in silico', bir bilgisayarda veya bilgisayar simülasyon yazılımı aracılığıyla gerçekleştirilen çalışmada, bir süreci veya deneyi tanımlar (ncdnadayblog)

 

https://en.wikipedia.org/wiki/In_silico

12 Temmuz 2024

 

GERİ (biyoloji)