Hesaplamalı Biyoloji (computational biology)

Hesaplamalı biyoloji, biyolojik sistemleri ve ilişkileri anlamak için veri analizinin, matematiksel modellemenin ve hesaplamalı simülasyonların kullanımını ifade eder.

Hesaplamalı biyoloji bilgisayar bilimi, biyoloji ve veri takımlarının kesiştiği alan, aynı zamanda uygulamalı matematik, kimya ve genetik alanlarında da temellere sahiptir. Bilgisayar oluşturmak için biyomühendisliği kullanan bilgisayar bilimi ve mühendisliğinin bir alt alanı olan ‘biyolojik hesaplama’dan farklıdır.

Hesaplamalı biyoloji, evrimsel biyolojiye şu yollarla yardımcı olmuştur:

·         Hesaplamalı filogenetik ile hayat ağacını yeniden oluşturmak için DNA verilerini kullanmak

·         Demografik veya seçici tarih hakkında çıkarımlar yapmak için popülasyon genetiği modellerini (ileri zaman veya geri zaman) DNA verilerine uydurmak

·         Neyin evrimleşmesi muhtemel olduğunu tahmin etmek için ilk ilkelerden yola çıkarak evrimsel sistemlerin popülasyon genetiği modellerini oluşturmak

Hesaplamalı biyolojiyle ilgilenen birkaç büyük konferans vardır; örnek olarak Moleküler Biyoloji için Akıllı Sistemler, Avrupa Hesaplamalı Biyoloji Konferansı ve Hesaplamalı Moleküler Biyoloji Araştırması gösterilebilir.

Ayrıca hesaplamalı biyolojiye adanmış çok sayıda dergi vardır. Bazı dikkate değer örnekler arasında hesaplamalı biyoloji alanında birçok önemli araştırma projesine sahip hakemli bir açık erişim dergisi olan Journal of Computational Biology ve PLOS Computational Biology yer almaktadır. Yazılımlar hakkında incelemeler, açık kaynak yazılımlar için eğitimler sağlar ve yaklaşan hesaplamalı biyoloji konferansları hakkında bilgi görüntüler.

(a) Tek bir organelden biyosferin tamamına kadar canlı organizmalar oldukça yapılandırılmış bir hiyerarşinin parçalarıdır (mdpi.com), (b) bir protein etkileşim ağı; hesaplamalı biyoloji alanında kullanılan metodlar sonucu elde edilmiş bir görsel (Wiki)

 

https://en.wikipedia.org/wiki/Computational_biology

12 Ağustos 2023

 

GERİ (biyoloji)