Biyoortogonal Kimya (bioorthogonal chemistry)

Biyoortogonal kimya terimi, doğal biyokimyasal süreçlere müdahale etmeden canlı sistemlerin içinde meydana gelebilecek herhangi bir kimyasal reaksiyonu ifade eder. Terim, 2003 yılında Carolyn R. Bertozzi tarafından icat edildi.

Biyoortogonal reaksiyon görüşü, tanıtılmasından bu yana çok çeşitli araştırmaya olanak sağladı:

·        hücresel toksisite olmaksızın canlı sistemlerde glikanlar, proteinler ve lipitler gibi biyomoleküllerin gerçek zamanlı olarak incelenmesine,

·        azidler ve siklooktinler arasındaki 1,3-dipolar sikloadisyon (aynı zamanda bakırsız klik kimyası olarak da adlandırılır),

·        nitronlar ve siklooktinler arasındaki 1,3-dipolar sikloadisyon,

·        aldehitlerden oksim/hidrazon oluşumu,

·        ketonlar, tetrazin ligasyonu, izosiyanür bazlı klik reaksiyonu,

·        kuadrisiklan ligasyonu.

Biyoortogonal kimyanın kullanımı tipik olarak iki adımda ilerler. İlk olarak, bir hücresel substrat, biyoortogonal bir fonksiyonel grupla (kimyasal raportör) modifiye edilir ve hücreye dahil edilir; substratlar arasında metabolitler, enzim inhibitörleri vb. yer alır. Kimyasal raportör, biyoaktivitesini etkilemekten kaçınmak için substratın yapısını önemli ölçüde değiştirmemelidir. İkinci olarak, substratı reaksiyona sokmak ve etiketlemek için tamamlayıcı fonksiyonel grubu içeren bir prob eklenir.

Bakırsız klik kimyası gibi etkili biyoortogonal reaksiyonlar geliştirilmiş olmasına rağmen, yeni reaksiyonların geliştirilmesi, aynı biyosistemlerde birden fazla etiketleme yönteminin kullanılmasına izin veren etiketleme için ortogonal yöntemler üretmeye devam etmektedir. Bertozzi, klik kimyası ve biyoortogonal kimyayı geliştirmesiyle 2022 yılında Nobel Kimya Ödülü'ne layık görüldü.


(a) Biyomolekül X ile reaktif ortak Y arasındaki bir biyoortogonal ligasyon, (b) biyoortogonal kimyadaki gelişmelerin ve kullanımlarının zaman çizelgesi (pubs.acs.org)

 

https://en.wikipedia.org/wiki/Bioorthogonal_chemistry

25 Ağustos 2023

 

GERİ (kimyanın dalları)
GERİ (kimya)